Resume : Le sinistre Baron Ashura, créature androgyne mi-homme mi-femme, est à la tête d'une invasion d'épouvantables monstres mécaniques géants qui détruisent tout sur leur passage. Cette attaque est le résultat de l'ambition du mégalomane Docteur Hell, un fou sanguinaire qui rêve de régner sur le monde.
Le seul à pouvoir s'opposer à ces monstres est Koji Kabuto, un jeune garçon qui, aux commandes du super-robot Mazinger Z inventé par son grand-père, affronte vaillamment l'adversaire avec ses courageux amis Sayaka et Boss. Hélas, cette fois, Mazinger Z n'est pas de taille et nécessite l'aide de Great Mazinger, une version encore plus puissante et aboutie que lui, pour repousser un assaut orchestré par tant d'ennemis... Mais même Great Mazinger est dépassé par les évènements. Mazinger Z est capturé par le Baron Ashura et Koji disparait dans la confusion...

Quelques temps plus tard, alors que les héros restants sont à peine remis sur pieds, une nouvelle attaque des forces du Docteur Hell, qui ont dompté la puissance de Mazinger Z, risque de mettre un terme à la défense héroïque du centre de recherche photonique... C'est là qu'apparait le mystérieux et gigantesque Mazinkaiser, un robot encore plus extraordinaire que les deux Mazinger réunis et qui est piloté par Koji Kabuto ! Le colosse vient à bout sans mal des créatures du Docteur Hell, qui n'aura dès lors de cesse de vaincre ce nouvel obstacle à ses desseins... Mais qui donc est réellement Mazinkaiser et d'où vient-il ?